上期我们分享了“空间组学样本制备指南 | 打造完美切片：DSP技术样本处理全攻略”

本期我们将大家常见的问题以及项目经验为大家整理成了FAQ，趁热打铁与您分享！

1、DSP（Digital Spatial Profiling）是一个空间多组学技术，这些组学可以同时检测吗？具体包含哪些组学呢？

答：可以在一张切片同时检测转录组和蛋白组。包含哪些具体组学产品见下图1。

2、ROI和AOI有什么区别呢？

答：在 Digital Spatial Profiling (DSP) 技术中，ROI（Region of Interest）是指在组织切片上由研究者根据形态学特征或标记物选择的感兴趣区域，是进行空间分子分析的总体框架。

AOI（Area of Illumination/Analysis）则是 ROI 内部进一步定义的分析单元，代表实际进行荧光照射、寡核苷酸释放及分子信息采集的空间范围。

换言之，ROI 是“宏观选区”，决定研究的整体区域；AOI 是“微观划分”，决定数据获取的精细尺度。二者的合理结合可实现从组织结构层面到分子分辨层面的空间多组学解析。（具体可全选圈选模式见下图2）

3、DSP成像marker可以自由选择吗？

答：不完全自由，主要受荧光通道的限制。DSP主要包含以下四种荧光通道：

4、DSP可以检测所有基因、蛋白表达吗？

答：并不能完全覆盖所有。DSP 的检测依赖于探针或条形码抗体：

RNA 层面：DSP 使用预设计或定制的探针 panel（例如全转录组 panel 或重点 panel），因此能够覆盖全转录组或特定感兴趣基因，但仍需依赖探针设计与验证，不是“无偏倚”的全转录组测序。

蛋白层面：DSP 的蛋白检测依赖于寡核苷酸偶联抗体，范围取决于官方提供的抗体 panel 或用户定制抗体集合，并非所有蛋白都可检测。

因此，DSP 更像是“靶向高通量检测平台”，而不是“检测一切”。

本期分享挑选了top问题进行解答，若您对DSP有其他疑问，请随时联系小备~

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