自动化靶向捕获测序文库制备的标准化解决方案:Biomek平台的技术突破
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靶向区域捕获测序(Targeted Capture Sequencing)是基于特异性寡核苷酸探针杂交原理,对预设基因组区域进行选择性富集的二代测序技术。该技术通过对目标区域的高深度测序,显著提升了变异检测的灵敏度和准确性,在保持优异检测性能的同时有效降低了测序成本,已成为基础研究和临床诊断领域的重要工具。

  

贝克曼库尔特(Beckman Coulter)开发的Biomek自动化靶向捕获测序平台,通过标准化液体处理工作站实现了从核酸提取、文库构建、定量混样到目标捕获的全流程自动化。该方案显著减少了人工操作时间,提高了实验通量,同时确保了实验结果的重复性和均一性。



图1. 自动化靶向捕获测序文库构建流程示意图

  

Biomek平台兼容的主流捕获试剂盒
• Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent
• Agilent SureSelect XT®
• Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input
• Illumina Nextera® Rapid Capture
• Illumina TruSeq® Exome
• Illumina TruSeq® Rapid Exome
• Illumina TruSight® Cancer
• Illumina TruSight® Tumor 15/170
• IDT xGen® Exome Research Panel
• NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel
• Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS

  

自动化捕获测序性能评估



图2. IDT xGen® Exome Research Panel试剂盒捕获效果分析。

上图:片段分析图谱(主峰1、2为cfDNA目标片段);下图:Qubit荧光定量结果



图3. IDT xGen®试剂盒手工操作与Biomek i7自动化工作站数据对比
A. 平均中靶率比较
B. 实验重复性分析
C. 覆盖均匀性评估
D. GC偏好性检测

   

智能化软件控制系统
Biomek平台配备向导式操作界面,支持用户自定义实验参数,包括:

  • 样本处理通量设置

  • 整合式PCR仪调用选项

  • 模块化流程选择

创新性的台面自动校准系统通过机器视觉技术实时监测耗材摆放位置,可自动识别并提示摆放错误,有效避免因人工失误导致的设备碰撞或试剂浪费。



图4. 软件操作界面展示(IDT xGen®试剂盒方法选择界面)

高通量自动化优势


图5. 不同样本通量(24/48/96样本)的自动化处理时间预估

   

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