TMA服务样本前处理指南
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一、目的

                

规范组织芯片(Tissue Microarray, TMA)送样指南,保证阵列位点完整、组织形态完好、抗原保存稳定,适用于后续 IHC、IF、PLA、原位杂交和 Nanostring DSP等实验。

                  

二、适用范围

                 

临床手术标本、动物组织福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的组织芯片制备。

              

三、组织固定要求

                 

1) 组织离体时间不宜超过 30min,应尽快固定;

修剪组织为标准大小:1cm×1cm×0.2~0.3cm,最大极限组织尺寸不超过:1.5cm×1.5cm×0.3cm,厚度不超过3mm,不小于1mm,过厚的组织块会导致固定和脱水不充分,影响后续切片质量,过薄的组织易造成脱水浸蜡过度、组织发脆,打孔取芯时易碎裂打穿,修块及切片中易缺失靶组织、位点空洞。

                       

2) 肿瘤样本:必须包含癌区、癌旁正常组织、交界区,避开大片坏死、出血、钙化区域,剔除缝线异物、严重脂肪空泡、挤压撕裂区域。尽量平整切面,不要褶皱、卷曲、挤压撕裂。

                

3) 组织固定液:推荐 10%NBF 或 4%PFA,10%NBF 穿透力强,4%PFA 穿透力弱一些;固定液体积是组织块体积的10-20倍,以达到组织充分固定的效果

                   

4) 固定时间:根据组织块大小而不同,0.5cm直径组织块一般 18-24h。固定时间不宜太长,>48h 过度固定(抗原遮蔽、RNA 降解)

          

四、FFPE 蜡块要求(如果送的样本为蜡块样本) 

               

1) 组织固定需符合 1 中的要求;

          

2) 存放条件:将蜡块放入干燥器中,保持干燥环境,室温保存;

              

3) 蜡块年龄:小于 3 年的蜡块 Nanostring 做过实验验证没有问题,3-10 年的蜡块Nanostring 项目做过类似服务可以得到比较理想结果,超过 10 年的蜡块需要客户自行验证蛋白与RNA 的完整性。

           

4) 蜡块质量:石蜡致密无空洞、无裂纹、无发白粉化。组织与蜡结合紧密,无脱裂、无空鼓。蜡块表面平整,无凹陷、无溢蜡过厚。

                   

五、HE复诊

             

做 TMA 前必须先切 HE 片染色:定位靶点、确认组织结构完好,再上机打孔。

              

1) 每例供体蜡块常规切片、裱片、HE 染色。

         

2) 病理镜下或扫描成像确认:癌区、癌旁、正常组织、病变靶点位置。

               

3) 用记号笔在蜡块表面精准圈定目标取材区域,避开坏死、钙化、出血区。

                

六、组织芯片排布 & 打孔常用规格

                  

1) 常用孔径:1.0 mm / 1.5 mm / 2.0 mm;芯间距 0.3~0.5 mm。

              

2.0 mm直径,5行*13列--65芯(大病灶、需更多细胞量)

1.5mm直径,8行*18列--144芯(最通用、常规临床样本首选)

1.0mm直径,10行*22列--220芯(微小病灶、穿刺标本、小动物组织、样本数量多阵列)

                   

2) 每例建议至少2~3 个复孔,减少位点缺失,满足统计学要求。

              

七、Nanostring DSP 专属规格(贴片区域是35.3mm*14.1mm)

                  

1) 2.0 mm直径,5行*13列--65芯

             

2) 1.5mm直径,6行*17列--102芯

              

3) 1.0mm直径,8行*20列--160芯

                      

八、送样要求

             

样本类型

运输方式

组织样本

放固定液后即可寄出(不需要等固定完再送),常温运输

石蜡组织块

常温干燥避光运输,防震打包

石蜡组织切片

密封干燥,加冰袋,4℃冷藏运输,防震打包

                                           

九、注意事项

               

1) 新鲜组织固定超时 / 固定液不对 → 抗原报废;

           

2) 蜡块粉化、开裂、组织空鼓 → 打孔掉芯、脱片;

               

3) 不先 HE 复诊直接打孔 → 打不到病灶、位点无效;

               

4) 组织过厚 / 过薄 → 脱水不佳、阵列高低不平;

              

5) 老旧多年蜡块强行做 TMA → 染色普遍无信号、背景极高;

                   


 

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