2023年6月，世界经济论坛发布了《2023年十大新兴技术报告》，其中空间组学技术被评选为未来可能对全球产生巨大影响的十大新兴技术之一。作为该领域的代表，NanoString GeoMx® DSP通过其创新的工作流程，将传统病理学和分子分析技术与高效的数据分析相结合，从而支持空间转录组学和蛋白质组学的研究。

这项技术的一个关键优势在于其能够处理多种具有挑战性的样本类型，包括甲醛固定石蜡包埋（FFPE）组织切片、新鲜冷冻样本、穿刺样本以及组织阵列芯片（TMA）。NanoString GeoMx® DSP能够在这些样本中精确地定位并量化蛋白质和全转录组的空间表达谱，从而极大地加快了生物标志物的发现和疾病机理的深入分析。这一技术已被广泛认可，在超过300篇同行评审的学术出版物中有所引用，显示出其在生物医学研究领域的重要价值和广泛影响力。

在DSP空间多组学技术中，空间转录组无疑是最令人瞩目的领域之一。空间转录组是一种新兴的研究领域，它不仅关注基因的表达模式，而且重视这些模式在组织中的具体位置。这一点对于理解细胞如何在不同组织环境中交互作用至关重要，尤其是在复杂的疾病状态下。空间转录组学的核心在于其能力，能够提供关于RNA分子在组织中的确切位置信息。这对于揭示细胞间的通信机制、理解组织内部的微环境，以及探索疾病的分子基础具有重大意义。

因此在应用上，DSP空间全转录组领域主要针对由多细胞组成的功能单元、细胞亚群和特定组织结构等进行空间原位的全转录组或蛋白的表达谱分析。

LabEx 提供DSP空间转录组整体解决方案

DSP空间全转录组技术实现了人类和小鼠组织原位全转录组表达分析。WTA方案不仅适用于常见样本类型，例如:福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、新鲜冷冻(FF)组织切片，还适用于所有组织类型。它能够对于每个目标区域(ROI)内的全转录组进行测量，帮助研究者高分辨率地探索组织微环境和细胞群之间的差异，以及背后详细的生物通路。

技术原理

DSP人空间全转录组优势

DSP小鼠空间全转录组优势

 应用案例

GeoMx DSP使您可以专注于解剖学和不同功能的重要组织结构与细胞类型，并为您整合所有小鼠实验中的空间转录组数据，而不仅限于几个选定的样本。通过大型群体分析获得重要信息，从而揭示遗传学、器官结构、解剖学特征、组织区域和治疗前后的空间表达谱变化。

正常成年小鼠大脑矢状切面在GeoMx DSP上的成像。对神经元蛋白α-突触核蛋白（绿色）和DNA（蓝色）进行染色来显示大脑复杂的组织形态结构，并进一步开展空间原位表达分析。α-突触核蛋白在突触囊泡运输和神经递质中发挥着关键作用。α-突触核蛋白的积累和聚集是  帕金森的一个标志，也是目前针对帕金森疗法的重要靶标。

细胞亚群定位

使用GeoMx SpatialDecon反卷积算法3对非小细胞癌样本进行空间分析，揭示了每个目标区域（ROI）的细胞类型及其丰度（下图）。研究人员可以使用预先定义的细胞亚型或单细胞RNA-Seq数据对得到的整个组织的细胞类型和丰度进行评估。