胃癌

Spatiotemporal genomic profiling of intestinal metaplasia reveals clonal dynamics of gastric cancer progression

IF：50.3

PANEL：GeoMx DSP + NGS | WTA (human)

摘要：

本文进行了一项10年前瞻性研究，分析了1256个胃部样本，揭示了26个与肠上皮化生（IM）相关的驱动基因。这些基因涉及多种途径，包括染色质调控和肠道稳态。IM的突变率高于正常胃组织，并与年龄呈弱相关。高幽门螺杆菌负担在IM患者中较常见，暗示其与IM发展有关。结合临床-基因组模型能更准确预测可能转化为GC的IM，为GC的精准预防提供了机会。此外，单细胞和空间分析突显了IM生态和谱系异质性的变化，包括一个与早期恶变相关的肠道干细胞主导的细胞区室。研究结果为理解胃癌前病变的分子机制提供了新见解，并为未来胃癌的预防和治疗策略的开发奠定了基础。

八名患者的前列腺切片包含组织学正常、IM、GC、淋巴聚集和基质区域，代表 480 个 ROI 和 76 个 CD45 分段的 AOI 的 Nanostring Digital Spatial Profiling (DSP) 空间剖面图

黑色素瘤

Assessing Longitudinal Treatment Efficacies and Alterations in Molecular Markers Associated with Glutamatergic Signaling and Immune Checkpoint Inhibitors in a Spontaneous Melanoma Mouse Model

Panel:GeoMx DSP + nCounter | protein (mouse) - immune cell profiling and the immune activation status panels

一系列研究在TGS（TG-3/SKH-1）自发性黑色素瘤易感小鼠模型中，评估了谷氨酸信号抑制剂和免疫检查点抑制剂troriluzole和anti-PD-1的治疗效果。这些研究揭示了治疗反应的性别差异，其中提高谷氨酸信号抑制剂剂量在雌性小鼠中改善了反应，而在雄性小鼠中观察到最大的肿瘤进展减少。此外，长期治疗后出现了治疗反应的丧失，这可能与分子标记物如xCT、g-H2AX、EAAT2、PD-L1和PD-1表达水平的变化有关。研究还强调了免疫细胞群体在肿瘤发展和治疗反应中的作用，并提出了使用高剂量troriluzole和anti-PD-1抗体联合治疗黑色素瘤的潜在策略。这些发现为troriluzole作为黑色素瘤治疗的潜在药物提供了证据，并为未来临床应用提供了支持。

在 6、12 和 18 周时，对所有治疗组的雌雄小鼠组织样本进行 GeoMx 数字空间成像分析，以评估肿瘤和肿瘤基质界面内免疫细胞浸润和细胞毒性 T 细胞的纵向变化。

实体瘤

Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial

IF：14.3

PANEL：GeoMx DSP + NGS | WTA (human)

摘要：

MATINS试验是一项针对晚期实体瘤患者的I/II期首次人体临床试验，评估了Clever-1阻断抗体bexmarilimab的安全性、耐受性及初步抗肿瘤效果。研究结果显示bexmarilimab具有良好的耐受性，没有剂量限制性毒性，并在多种癌症类型中观察到25%-40%的疾病控制率。疾病控制与改善的生存期相关，并与治疗前肿瘤内Clever-1的高表达和治疗过程中血清干扰素γ(IFNg)水平升高有关。空间转录组学分析表明，bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活和IFNg及T细胞受体信号的刺激仅在达到疾病控制的患者中出现，这表明通过靶向巨噬细胞可以促进免疫激活和晚期癌症的肿瘤控制。这些发现为进一步优化和验证bexmarilimab治疗的患者富集策略提供了依据，并为癌症免疫治疗提供了新的策略。

 GeoMx 空间谱分析揭示了直流电患者体内 TAM 的促炎性转化

扁桃体癌症

Targeted spatial proteomic analysis of CD8+ T- and myeloid cells in tonsillar cancer

IF：4.7

PANEL：GeoMx DSP + nCounter | protein (human) - Immune cell profiling, Immunology drug targets, Immune activation status, Immune cell typing

摘要：

该研究通过免疫荧光和靶向空间蛋白质组学方法，对105例扁桃体癌患者的肿瘤微环境中的CD8 T细胞和髓系细胞进行了分析。研究发现，总CD8细胞和浸润癌细胞岛的CD8细胞的丰度与5年无病生存率和总生存率正相关，这一结果独立于HPV状态和临床分期。研究还发现，肿瘤内CD8 T细胞表达的PD-L1与全因死亡率降低相关。此外，研究还表明，扁桃体癌中HLA-I和HLA-II的表达与生存无关，但与免疫浸润和标准治疗以及免疫治疗的反应有关。最后，研究通过使用QuPath软件对CD8细胞进行定量分析，发现CD8细胞的数量与总生存期（OS）呈正相关。总的来说，这项研究强调了免疫细胞浸润在扁桃体癌预后中的重要性，并为未来的治疗策略提供了可能的靶点。

(A）将来自 105 个扁桃体癌样本和 4 个健康对照扁桃体的 FFPE 活检样本的核转移到 TMA 上，并进行 GeoMX DSP 蛋白面板实验程序。(B）使用 DNA 染色法和针对 PanCK、CD8 和 CD11c 的荧光色素偶联抗体对活检样本进行形态学评估。