小优: 小备,我听说了一种GeoMx DSP空间组学技术,可以把组织切片变成“谷歌地图”。你知道他是怎么实现的吗?
小备: GeoMx DSP是NanoString公司开发的数字空间分析技术(GeoMx Digital Spatial Profiler)平台,一种革命性的空间组学技术,能够将组织切片转化为数字化的“谷歌地图”。想象一下,我们手头有一张复杂的组织切片,就像是一幅包含了无数细节的地图。传统的单细胞测序技术虽然能够提供细胞内部的详细信息,但它们丢失了细胞在组织中的具体位置信息。而传统的病理学虽然能够展示组织的整体图像,却无法精确地告诉我们每个细胞或蛋白质分子的具体情况。GeoMx DSP技术的出现,就像是给了我们一把能够精确定位每个细胞和蛋白质分子的激光笔。
小优: 听起来很有趣,但我还是不太明白它是如何工作的。
小备: 好的,让我来详细解释一下。
这是GeoMx DSP的工作流程图。首先,我们使用一种可编程的激光技术,它能够精确地“指哪打哪”,从组织切片中切割出微小的区域,这些区域的大小可以从10*10μm~660*770μm不等。
小优: 哦,我明白了,就像是用激光笔在地图上标记位置一样。
小备: 没错,正是这样。然后,这些被切割下来的微小区域会进行RNA或蛋白质的提取和分析。这个过程就像是在地图上标记出不同地点的详细信息。
小优: 那这个技术有什么特别之处呢?
小备: GeoMx DSP有三个关键词可以概括它的特点:
Spatial(空间):它能够保留样本的X-Y-Z三维坐标信息,这意味着我们可以知道每个分子的精确位置。
Multiplex(多重性):一次实验可以同时检测20000+个RNA或570+个蛋白质,这大大提高了研究的效率和深度。
High-Throughput(高通量):一天可以处理40多片组织切片,这对于大规模研究来说是非常有利的。可以短期拿到结果。
小优: 真不错,DSP可以实现这么多功能。那对样本类型有要求吗?
小备: DSP可以兼容多种样本,新鲜组织、FFPE、冰冻样本、TMA组织芯片、穿刺样本等等都可以的。
小优: DSP听起来很有意思呀,我有很多切片,会不会要做的多就很贵了?
小备: DSP芯片超大面积36.2mm*14.1mm,面积很大,可以实现多个组织拼片哦,可以平衡批间差异,减少成本。
小优:哇,这个技术真丰富可以实现好多想法,我设计一下课题方案,就做DSP啦!!!
小备:欢迎欢迎,有什么疑问,还可以联系我们哦~