空间生物学是生命科学领域的革命性突破方向，而数字空间转录组（DSP）技术作为空间多组学的核心支撑，彻底打破了传统转录组研究丢失空间位置信息的局限。上海乐备实（Labex）引入GeoMx DSP技术平台，打造专业化空间转录组检测服务，实现基因表达信息与组织空间定位的精准关联，为疾病机制研究、生物标志物筛选及靶向治疗开发提供全新技术路径。本文将系统解析乐备实 DSP 空间转录组技术的核心优势、应用价值及临床转化潜力。
一、DSP 空间转录组技术原理与背景
1.1 技术背景
空间多组学技术自 2020 年被《Nature Methods》评为 “年度技术” 后，持续成为生命科学领域的研究热点，2022 年再次被《Nature》列为高关注度技术。传统单细胞转录组虽能解析细胞异质性，却丢失了关键的空间位置信息，而 DSP 空间转录组技术完美弥补这一缺陷，实现 “基因表达 + 空间定位” 的双重维度解析，为揭示组织微环境中细胞互作机制提供了可能。乐备实基于 NanoString GeoMx DSP 技术平台，构建了覆盖 RNA 和蛋白质水平的空间多组学检测体系，成为转化医学研究的核心技术支撑。
1.2 核心原理
DSP 技术的核心是通过 “荧光标记 - 区域选择 - 信号捕获” 的闭环流程，实现特定空间区域的分子表达谱分析。其关键技术原理包括三点：
一是采用寡核苷酸标签标记抗体或 RNA 探针，实现蛋白质或 RNA 的多重信号读取；
二是通过光切割接头将标签与亲和试剂连接，可精准释放目标区域的分子信号；
三是通过定制化光投射模式，灵活选择 1 至 5000 个细胞组成的感兴趣区域（ROI），实现针对性检测。
该技术可同步解析约 20000 个 RNA 或 100 种蛋白质的空间表达信息，为深度挖掘分子调控网络提供全面数据支撑。
二、DSP 空间转录组技术操作流程
基于标准化实验流程与专业技术团队，构建了高效稳定的 DSP 检测服务体系，核心操作流程如下：
- 样本制备与处理：兼容福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）、新鲜冻存组织、穿刺样本及组织芯片（TMA）等多种样本类型，无需复杂解离，直接保留组织原始结构。样本经脱蜡、抗原修复后，进行核酸或蛋白水平的探针 / 抗体孵育。
- ROI 区域定义与标记：结合病理形态学特征，通过激光扫描精准圈定目标感兴趣区域（如肿瘤核心区、肿瘤 - 基质界面、正常组织对照区等），实现特异性区域选择。
- 光切割与信号释放：通过特定波长激光照射目标区域，触发光切割接头断裂，释放带有特异性标签的寡核苷酸分子，确保信号的空间特异性。
- 信号检测与数据分析：回收释放的标签分子，通过 nCounter 数字条码技术进行高通量信号检测，结合乐备实定制化分析流程，生成基因表达矩阵、空间表达图谱、差异分析结果及功能富集报告，实现从数据到结论的完整转化。
DSP空间组学适配样本三、DSP 空间转录组技术对比基础实验的核心优势
相较于传统转录组测序、免疫组化等基础实验技术，乐备实 DSP 空间转录组技术具有显著优势：
- 空间信息完整保留：突破传统转录组 “丢失空间坐标” 的瓶颈，实现基因表达与组织位置的精准对应，真正揭示 “哪里的细胞在表达什么基因”。
- 样本兼容性极强：针对临床最常见的 FFPE 样本表现优异，打破困难样本与前沿技术的应用壁垒，充分利用临床存量样本资源。
- 高通量与高灵敏度兼顾：同步检测数千个基因或上百种蛋白，单细胞级灵敏度可精准捕获低丰度分子表达信号，兼顾广度与深度。
- 灵活定制化检测：可自由选择任意感兴趣区域，支持多区域对比分析，精准聚焦关键病理区域的分子特征，避免整体检测的信号稀释。
- 多组学整合能力：同时支持 RNA 和蛋白质水平检测，可与单细胞测序数据联合分析，实现 “细胞身份定义 + 空间位置定位 + 功能机制解析” 的研究闭环。
四、技术应用：赋能肿瘤内科胃癌精准研究
胃癌作为全球高发恶性肿瘤，其异质性强、预后差异大的特点给临床诊疗带来巨大挑战。乐备实 DSP 空间转录组技术针对肿瘤内科胃癌研究的核心需求，提供全方位技术支撑：
4.1 疾病研究核心方向
- 胃癌肿瘤微环境异质性解析：精准区分肿瘤核心区、肿瘤 - 基质界面（TSI）、癌旁正常组织的分子表达差异，揭示不同区域的细胞组成与功能特征。
- 转移相关机制研究：聚焦 TSI 区域的分子互作网络，挖掘促进肿瘤侵袭转移的关键信号通路与调控基因。
- 免疫治疗疗效预测：分析免疫细胞在肿瘤组织中的空间分布特征，评估免疫检查点分子的空间表达模式，为免疫治疗方案选择提供依据。
- 预后标志物筛选：鉴定与胃癌患者生存期相关的空间特异性分子标志物，助力临床预后分层。
4.2 解决的核心研究难题
- 突破异质性解析瓶颈：传统检测难以区分肿瘤组织中不同亚群的分子特征，DSP 技术可精准定位高侵袭性肿瘤亚群（如 G2 亚型）的空间分布，揭示其与免疫抑制微环境的关联。
- 阐明细胞互作机制：明确肿瘤细胞与癌相关成纤维细胞、免疫细胞的空间共定位关系，解析 “细胞 - 细胞” 通讯的分子基础，如 TSI 区域 GREM1+ myCAF 细胞与肿瘤细胞的互作机制。
- 挖掘潜在治疗靶点：发现空间特异性高表达基因（如 SOX9、ITGB1 等），为靶向药物研发提供全新靶点，部分靶点已通过 CRISPR 筛选验证其促肿瘤功能。
- 优化临床样本利用：基于 FFPE 样本的高效检测能力，充分挖掘临床存量样本的科研价值，降低样本收集难度，加速转化医学研究进程。
五、DSP 空间转录组检测技术哪个公司提供？
上海乐备实（U-Labex）是国内 DSP 空间转录组技术服务提供商，依托 GeoMx DSP 平台打造了标准化、高性价比的检测服务体系。其产品有：
| 货号 | 产品名 |
| LXDSWH48-1 | DSP人空间全转录组图谱_WTA_48 |
| LXDSCH24-1 | DSP人癌症空间转录组图谱_CTA_24 |
更多产品详情可访问乐备实官方网站查询。
结语
DSP 空间转录组技术通过 “空间定位 + 高通量分子检测” 的核心优势，彻底革新了组织生物学研究模式，尤其在肿瘤内科胃癌等疾病的异质性解析、机制研究及靶点发现中发挥不可替代的作用。凭借兼容临床样本、高灵敏度、灵活定制等技术特点，乐备实将持续为科研工作者提供专业的技术支撑，加速疾病机制研究与临床转化进程，为精准医疗发展注入核心动力。
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