单细胞多组学利器 ——Abseq 同步检测蛋白与 mRNA 表达
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蛋白质是细胞功能的核心执行者,广泛参与代谢调控、结构维持、信号转导等关键生命活动。精准解析蛋白质的表达水平与修饰状态,对揭示细胞真实状态与功能机制至关重要。
 
流式细胞术是传统单细胞蛋白分析的常用手段,通过荧光标记抗体实现蛋白检测,但受荧光光谱重叠限制,可检测靶点数量有限,难以实现高通量分析,且对低丰度蛋白的检测灵敏度不足。质谱流式虽在检测通量与灵敏度上有所提升,但存在仪器成本高昂、操作流程复杂、样本前处理要求严苛、无法同步获取细胞代谢信息等问题,在大规模单细胞蛋白分析中应用受限。因此,开发兼具高灵敏度与高通量的单细胞蛋白质分析技术已成为迫切需求。
 
微流控技术的快速发展为单细胞分析提供了有力支撑,可在微纳尺度内精准操控细胞与试剂,完成单细胞捕获、裂解、扩增及检测等一体化操作,具有高通量、高灵敏度、低试剂消耗等显著优势。基于微流控平台的 Abseq 技术,成功实现了单细胞水平蛋白质的高通量、高灵敏度检测。
 
本期为大家分享单细胞多组学研究利器 ——BD AbSeq,可在单一样本实验中同时检测蛋白质与 mRNA 表达,助力更深入地理解蛋白质生物学功能,高效推进单细胞相关科研进程。
 
1、技术原理
 
BD AbSeq 采用寡核苷酸偶联抗体(Ab-oligos),通过高通量测序实现蛋白表达定量。该技术为每个抗体克隆均偶联一段特异性寡核苷酸序列,序列中包含抗体特异性条形码(ABC),并在其两端分别设计 3' poly (A) 序列与 5' 通用 PCR 扩增序列。利用二代测序对抗体特异性条形码(ABC)进行测序解码,即可实现蛋白丰度的精准检测。将 BD AbSeq 与单细胞分析系统联用,可在同一样本中同步实现 mRNA 与蛋白表达的联合检测
 
2、技术优势
(1)多组学分析助力细胞类型鉴定
BD AbSeq 可同步获取高参数蛋白质表达数据与单细胞 RNA-Seq 数据,通过补充细胞类型特异性特征信息,显著优化细胞类型聚类效果,助力更精准地分析、表征细胞特性,深入阐明从 mRNA 转录到蛋白质调控表达全过程中的核心生物学机制。
如图所示,对健康个体外周血单核细胞(PBMCs)的分析结果表明:整合 mRNA 与蛋白质的多组学数据,相比单一 mRNA 数据,能更精准地定义细胞类型,实现更清晰的细胞聚类,有效提升细胞分型的准确性与可靠性。
 
(2)检测低表达 mRNA 相关蛋白靶点
BD AbSeq 能精准揭示 mRNA 与蛋白表达的非同步关系
针对 CD4、γδTCR 受体等表达不相关的分子,蛋白数据可划分出更精细的细胞亚群
对 PD‑1 这类 mRNA 表达量极低、难以被转录组检测的分子,BD AbSeq 可在蛋白水平识别其表达差异,对解析药物响应机制至关重要。
 
(3)发现新的差异表达基因
CD45 基因的不同剪接异构体(CD45RA/CD45RO)无法通过常规 3’ RNA‑seq 区分,而 BD AbSeq 可直接识别对应蛋白,精准分群初始 T 细胞(naïve)与记忆 T 细胞(memory)亚群
这种多组学联合分析,有助于在高度异质的细胞群中开展全面的基因表达解析与生物标志物挖掘
 
(4)观察免疫细胞早期反应
在免疫细胞激活研究中,BD AbSeq 可同步监测早期 RNA 与蛋白的动态变化,在刺激 4 小时后即可捕捉到多种激活标志物的显著改变,并可依据细胞反应模式定义全新细胞亚群,助力新型标志物发现。
 
(5)探究基因调控机制
通过小分子抑制剂分别抑制 PBMC 激活过程中的转录、翻译及蛋白酶体活性,结合 BD AbSeq 与 BD Rhapsody 平台可发现:
TNF mRNA 与 CD69 蛋白在不同细胞类型中存在截然不同的调控模式
该方案可用于在复杂样本中,系统解析多种细胞类型的基因表达调控机制
 
3、Ab-seq单细胞蛋白组检测哪里有?
乐备实提供Ab-seq蛋白组检测服务,最高可达203种指标:
 
货号 产品名
LXBABH203-1 AbSeq 203Panel(必须搭配BD WTA)

 


 

乐备实(上海优宁维生物科技股份有限公司旗下全资子公司),是国内专注于提供高质量蛋白检测以及组学分析服务的实验服务专家,自2018年成立以来,乐备实不断寻求突破,公司的服务技术平台已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、超敏电化学发光、Luminex多因子检测、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫组化、DSP空间多组学等30多个,建立起了一套涵盖基因、蛋白、细胞以及组织水平实验的完整检测体系。

 
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