PLA蛋白互作多领域经典配对
作者:乐备实高级产品经理 浏览次数:64 分享:

基础信息:电压依赖性阴离子通道蛋白 1(VDAC1)

                   

定位:线粒体外膜(OMM)的多功能蛋白,均匀分布在线粒体表面。

        

作用:在调控细胞代谢与细胞凋亡过程中发挥关键作用。VDAC1介导线粒体与细胞质之间代谢物、离子及小分子物质的转运,包括 ATP、ADP 与钙离子,以此调控两大细胞器间的代谢交互。此外,VDAC1 可形成通道,将细胞色c等促凋亡蛋白释放至细胞质,参与线粒体介导的细胞凋亡通路。该蛋白可与超过150种蛋白发生相互作用,其中包含 Bcl-2、己糖激酶等抗凋亡蛋白;这类蛋白常在肿瘤细胞中高表达,因此 VDAC1 有望成为肿瘤治疗的潜在靶点。

                    

                       

图1:肿瘤组织中VDAC1的组织表达图谱

                 

VDAC1 为线粒体外膜互作核心枢纽,所有配对均满足 PLA 距离阈值(<40 nm),适配细胞爬片、FFPE 石蜡组织,为顶刊高频使用组合。

以下为MAM 内质网 - 线粒体钙轴金标准 Panel(最主流,神经 / 心血管 / 代谢 / 肿瘤通用)

                  

PLA配对组合

复合物功能

适用模型/组织

PLA信号定位

实验核心目的

VDAC1 + IP3R1

ER - 线粒体钙转运三元复合物核心配对(GRP75 桥接)

脑、心肌、肝脏、肿瘤、胰岛细胞、神经退行模型

胞质点状(MAM 区域)

定量 MAM 接触位点、钙转运强度、ER 应激程度

VDAC1 + IP3R2

 MAM 钙转运复合物

心肌细胞、肝细胞、星形胶质细胞、肾小管、唾液腺、胰岛

胞质点状 MAM 区域

心肌肥厚、脂肪肝、肝胰岛素抵抗、星形胶质钙信号研究

VDAC1 + GRP75

MAM 分子桥接蛋白互作

所有 MAM 相关模型

胞质线粒体周边

验证 IP3R1-VDAC1 复合物形成依赖 GRP75;功能对照标配

GRP75 + IP3R1

MAM 三元复合物另外两端配对

神经退行、糖尿病心肌病

ER - 线粒体交界

三联配套 PLA,完整表征三元复合物稳定性

GRP75 + IP3R2

MAM 内质网端桥接复合物

原代心肌 / 肝细胞、心 / 肝 FFPE 组织

胞质点状 MAM 区域

评估三元复合物组装、钙转运通路完整性

                                      

三元复合物基础结构: IP3R1/IP3R2 — GRP75 — VDAC1( 多重 misPLA 同步检测,最多可以9重的PLA,8对互作+DAPI)

                  

1. 神经研究专用三联 Panel(IP3R1 体系)

              

VDAC1–IP3R1(整体 MAM)

VDAC1–GRP75(线粒体端结合)

IP3R1–GRP75(内质网端结合)

                

适用:AD、帕金森、脑缺血、肿瘤神经侵袭

                   

2. 心血管 / 代谢肝脏专用三联 Panel(IP3R2 体系)

                 

VDAC1–IP3R2(整体 MAM)

VDAC1–GRP75(线粒体端结合)

IP3R2–GRP75(内质网端结合)

                  

适用:心衰、心肌肥厚、I/R 损伤、NAFLD、胰岛素抵抗

                  

其他热门panel

                       

PLA配对组合

复合物功能

适用模型/组织

PLA信号定位

实验核心目的

PD-L1–PD-1

免疫抑制突触

各类实体瘤,免疫治疗耐药模型、移植瘤、人临床肿瘤标本

细胞膜点状,间质少量散点

评估肿瘤微环境免疫抑制强度,预测免疫检查点抑制剂(抗 PD-1/PD-L1)临床响应

IRP1–ISCU

铁硫簇转运组装复合物

原代神经元、肌细胞、肝 、脑 、肌肉

全胞质弥散点状

铁稳态、铁死亡、线粒体肌病、神经退行、肿瘤铁代谢研究

OPN–CD44

 肿瘤细胞膜配体 - 受体复合物

肿瘤 、心瓣膜 、 肝 、 肺纤维化组织

细胞膜点状

肿瘤干细胞 、 侵袭 、钙化 、纤维化

OPN–CD11b

配体 - 巨噬受体复合物

肿瘤、肝 、 肺 / 肾纤维化、动脉粥样硬化、脑组织(小胶质)、心肌损伤组织

巨噬细胞膜交界点状

评估 TAM 活化、慢性炎症、纤维化程度

Integrin α5  – NAMPT

 细胞膜整合素受体复合物

肠 、胃 、肺 、 血管 、肿瘤组织

细胞膜点状

评估炎症浸润、血管紊乱、肿瘤免疫逃逸、ICB 耐药标志物

 Integrin α5-Cx43

介导骨合成、细胞间力学同步通讯

骨骼 、纤维化 、  神经 、血管

细胞膜点状

经典金标准配对,骨研究最常用,评估骨重塑、纤维化、血管内皮力学稳态

Integrin α5 – Piezo1

双机械感受器协同复合物

骨骼 、纤维化 、  肿瘤基质 、心血管

细胞膜点状

检测两大机械感受器协同组装程度,多用于动脉粥样硬化、脏器纤维化、肿瘤硬化微环境

                               

                      

图2:VDAC和IP3R1的PLA配对结果

                    

PLA 斑点数量上升:MAM 过度耦联,钙大量流入线粒体,钙超载、mPTP 易开放,神经元损伤、肿瘤细胞凋亡抵抗;

                

PLA 斑点数量下降:MAM 结构解离,钙转运受阻,线粒体能量合成不足,细胞保护性钙信号缺失。

                     


 

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