全转录组测序通过整合mRNA及多种非编码RNA（包括small RNA、lncRNA、circRNA）的检测，在单一实验中捕获转录组的全景信息，为揭示生命现象背后的多层次调控机制提供了核心数据基础。基于竞争性内源RNA（ceRNA）假说，mRNA、lncRNA和circRNA通过miRNA应答元件（MREs）相互竞争结合同一miRNA池，形成复杂的转录后调控网络，该网络在发育、代谢及肿瘤进程中发挥着重要功能。
mRNA携带从DNA转录的遗传信息，在细胞质中通过核糖体翻译为蛋白质。其表达水平受转录起始、mRNA加工、转运及降解等多层级调控，是执行细胞功能的核心分子载体。在全转录组调控网络中，mRNA不仅是蛋白质合成的模板，更是ceRNA网络中的关键效应节点——其3'UTR区域包含大量miRNA结合位点，可竞争性地结合miRNA并影响其他靶基因的去抑制水平。
microRNA是一类长度约22个核苷酸的内源性非编码RNA，通过其5'端种子序列（第2-8位核苷酸）与靶mRNA的3'UTR区域进行不完全碱基互补配对，进而招募Argonaute蛋白（Ago）形成RNA诱导沉默复合体，介导靶mRNA的降解或翻译抑制。作为ceRNA网络的核心调控者，microRNA的活性直接影响大量下游靶基因的表达稳态。
长链非编码RNA（lncRNA）泛指长度超过200个核苷酸、不具备蛋白编码潜能的转录本。其功能作用方式具有高度多样性：其一，作为"分子海绵"吸附microRNA，通过竞争性结合降低游离microRNA的有效浓度，从而解除microRNA对靶mRNA的抑制作用——这是lncRNA参与ceRNA网络的核心模式；其二，直接与mRNA通过碱基互补配对结合，影响mRNA的稳定性或翻译效率；其三，在转录水平通过引导染色质修饰复合物至特定基因座，调控基因的表观遗传状态。
circRNA由线性前体mRNA通过反向剪接（backsplicing）形成共价闭合环状结构，不具有5'帽和3'poly(A)尾，使其对核酸外切酶降解具有高度抗性，在细胞中呈现更长的半衰期。circRNA富含miRNA结合位点，可作为高效的miRNA海绵，通过竞争性吸附miRNA来间接调控下游靶基因的表达。部分circRNA还被发现具有翻译为短肽的潜力。
以肿瘤耐药研究为例，常规流程包括：对敏感株与耐药株进行全转录组测序，在mRNA、lncRNA和circRNA三个层面分别识别差异表达分子；对差异表达的lncRNA和circRNA进行miRNA结合位点预测，并结合差异表达miRNA数据，构建由"lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA"组成的三元调控网络；通过网络拓扑分析筛选处于枢纽位置的ceRNA节点，其可能代表驱动耐药的关键调控因子。
随着测序成本持续下降，基于大样本队列的全转录组测序已成为构建疾病特异性ceRNA调控图谱的主流模式。通过整合基因组变异、DNA甲基化与转录组数据，研究者可进一步优先考虑受启动子甲基化或拷贝数变异驱动的差异转录本，提高ceRNA网络中因果关系的推断准确性。
| 货号 | 产品名称 | 指标 |
|---|---|---|
| LXDSWH12-1 | DSP人空间全转录组图谱_WTA_12检测服务 |
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| LXDSWH48-1 | DSP人空间全转录组图谱_WTA_48检测服务 |
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