荧光原位杂交(FISH)荧光共定位的定量分析
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一、FISH 荧光共定位的技术意义

    

荧光原位杂交(Fluorescence In Situ Hybridization, FISH)荧光共定位技术,是检测细胞核内特定核酸序列(如 DNA 片段、mRNA)空间分布与关联的核心方法,广泛用于基因定位、染色体异常筛查及基因表达调控研究。什么是多重荧光共定位FISH - 一种能同步高精度检测多个靶点的技术。
实验中通过不同荧光标记的探针(如红色荧光探针靶向序列 A、绿色荧光探针靶向序列 B),可获得双荧光或多重荧光染色图像,直观呈现目标序列的共定位趋势。但仅通过肉眼观察与定性描述,无法精准量化共定位程度,需借助标准化定量分析流程,获取客观数据以支撑实验结论的科学性与重复性。
     

二、FISH 荧光共定位定量分析的操作步骤(以 Image Pro Plus 为例)

   

(一)图像导入与功能调用

1.启动 Image Pro Plus 软件,导入 FISH 实验获得的共定位图像(含目标核酸序列的红色荧光通道与绿色荧光通道);

 

红色通道

绿色通道

2.点击顶部菜单栏 “Measure” 选项,在下拉列表中选择 “Co-localization” 功能模块,进入共定位分析界面。

 

(二)通道参数设置与散点图生成

1.针对 FISH 实验的红绿双荧光通道,在弹出的参数设置窗口中,将 “Channel 1” 指定为红色荧光通道(对应序列 A 探针),“Channel 2” 指定为绿色荧光通道(对应序列 B 探针),确认无其他通道干扰后点击 “Forward”;

 

2.系统自动生成 “红色 - 绿色荧光强度散点图”:横轴代表红色通道荧光强度,纵轴代表绿色荧光通道荧光强度。若散点集中分布于对角线附近,提示两种目标核酸序列的荧光信号相关性强,初步表明存在共定位趋势。

 

(三)定量参数计算与结果输出

1.在后续参数设置界面中,勾选 “Pearson Correlation Coefficient(皮尔逊相关系数)” 与 “Overlap Coefficient(重叠系数 R)” 计算选项,点击 “Forward”;

 

   

2.系统基于散点图数据进行线性回归分析,输出定量结果:皮尔逊相关系数反映两通道荧光信号的线性相关程度(取值范围 - 1~1,越接近 1 相关性越强),重叠系数 R 反映荧光信号的空间重叠比例(取值范围 0~1,越接近 1 重叠度越高)。例如,若输出皮尔逊相关系数为 0.919、重叠系数 R 为 0.932,表明两种目标核酸序列的共定位程度极高。

   



三、核心结果报告要求

    

FISH 荧光共定位定量分析中,红绿通道散点图、皮尔逊相关系数、重叠系数 R 是不可或缺的核心数据,需在论文中完整报告:散点图直观展示信号分布特征,两个系数则从统计学层面量化共定位水平,三者结合可全面论证目标核酸序列的空间关联,确保实验结论的客观性与说服力。

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