一、技术原理：捕获单细胞水平的染色质开放态密码

   

二、标准化操作流程：从样本到数据的全链条质量管控

1. 样本预处理：接收新鲜组织、细胞系或临床样本后，由专业技术团队进行单细胞或单核分离，针对肿瘤组织等复杂样本采用优化的解离方案，保障细胞活性与核完整性，核得率稳定在50%以上。
2. 转座反应与文库构建：采用专利优化的转座反应体系，对单个细胞核进行精准标记，微孔板技术实现单细胞捕获与磁珠结合，确保每个微孔仅包含一个细胞核，避免交叉污染。
3. 测序与质控：测序深度根据研究需求设定为50-100G；关键质控指标包括映射率（>80%）、峰检出数（>5000个/细胞）、线粒体读数比例（<5%），确保数据质量达标。
4. 生信分析：提供标准化与个性化结合的分析方案，基础分析包括细胞分群、差异开放区域识别、motif分析及转录因子预测；高级分析可整合单细胞RNA-seq数据，构建调控网络并进行疾病标志物筛选。

三、核心技术优势：相较于基础实验的突破性提升

• 单细胞分辨率解析异质性：突破群体实验“平均化”局限，可精准识别肿瘤组织中癌细胞亚群、肿瘤微环境免疫细胞的染色质开放差异。
• 多组学整合能力更强：支持与单细胞RNA-seq、CITE-seq等技术联合分析，实现“表观调控-基因表达-蛋白表达”的多维度数据关联。
• 高灵敏度与稳定性：采用优化的转座酶体系与捕获技术，建库成功率稳定在90%以上，可检测低丰度细胞亚群的染色质开放变化，相较于传统技术灵敏度提升30%以上；针对临床小样本（如穿刺样本）设计专用方案，样本需求量低至10万个细胞。
• 一站式数据分析服务：配备专业生信分析团队，提供从基础质控到高级定制化分析的全流程服务，开发专属云分析平台与AI辅助解读工具，可快速生成细胞分群图谱、差异调控区域注释及标志物筛选结果，降低研究人员分析门槛。

四、临床研究赋能：助力肿瘤科肝癌精准研究的突破

1. 技术在肝癌研究中的核心应用场景

• 早期诊断标志物筛选：通过对比肝癌患者癌旁组织与正常肝组织的单细胞染色质开放谱，识别肝细胞癌变早期的特异性表观标志物。例如在研究中发现铜蓝蛋白（CP）基因启动子区域开放程度与肝癌发生密切相关，且其表达水平与患者生存率负相关，可作为潜在早期诊断指标。
• 治疗应答预测与方案优化：针对接受PD-1抑制剂治疗的肝癌患者，通过测序分析治疗前后肿瘤浸润免疫细胞的染色质开放变化，识别免疫应答相关的表观调控特征。研究证实，治疗应答患者的CD8+T细胞中IFN-γ通路相关基因启动子区域开放性显著升高，可作为预测免疫治疗效果的表观标志物。
• 复发机制解析与预后评估：对肝癌复发患者的肿瘤样本进行测序，发现复发灶中肿瘤起始细胞（TICs）存在独特的表观调控模式，如HIF1A、KLF9等转录因子结合区域开放性异常，通过调控糖酵解通路促进肿瘤复发，为开发复发干预靶点提供依据。

2. 解决肝癌研究的关键难题

• 攻克肿瘤异质性解析难题：传统研究难以区分肝癌组织中癌细胞亚群、癌相关成纤维细胞及免疫细胞的表观差异，而单细胞ATAC测序可清晰界定各细胞亚群的染色质开放特征，例如明确CD49fhigh肿瘤起始细胞的表观调控网络，揭示其与免疫抑制中性粒细胞的互作机制。
• 突破治疗应答预测精准度低的瓶颈：基于表观遗传特征构建的治疗应答预测模型，准确率较传统基因表达模型提升40%以上，可有效区分潜在获益患者与无应答患者，避免无效治疗带来的医疗资源浪费。
• 填补复发机制表观调控研究空白：首次在单细胞水平揭示肝癌复发过程中的表观遗传重编程事件，发现BAP1突变导致的染色质可及性增加与复发风险正相关，为开发靶向表观调控的复发预防策略提供了直接靶点。